在柔性版印刷生产过程中，若生产工艺控制不当，容易出现网点丢失和变形扩大等质量问题，如版面高光部位的小网点易丢失，暗调网点部位容易出现扩大、糊版而变成实地似的。所以，柔性版印刷工艺难以表现5%以下的网点，95%以上的网点又很容易糊成一团，中间调和暗调部位则很容易损失。同时，由于柔性版材的延展性，使得版面套印的精度也很难提高。由于网点的扩大变形，使印品版面缺乏层次感，印刷复制质量就明显下降。
可见，印刷版材柔软、弹性大，是柔性版印刷网点容易出现质量问题的主要原因所在。工艺分析情况表明，柔性版印刷过程中，在压力作用下，印版的图文尺寸变大，使网点面积也变大，而细小的点子容易因磨损或压力不均匀而丢失。另一方面由于柔性版印刷采用低黏度的油墨，当印版表面与印品之间的接触压力稍微大一点，印版上的油墨即会向外铺展，使扩大的网点中间墨层薄而边缘的墨层厚，形成类似空心的点，当用放大镜去观察可见到网点边缘糊掉，这就是柔性版印刷网点增大的基本特征。
生产工艺情况还表明，柔性版的网点线数越高，网点增大值就越大；所用油墨的颗粒越粗，网点扩大也越大；版面输墨量越大或油墨过稀，网点扩大也越大；印刷压力和网纹辊压力越大，网点扩大也越大；承印物、胶辊、衬垫或柔性版越软，网点扩大也越大；机器使用老化导致精度越差的，网点扩大也越大。此外，印版厚度不一致，也容易使印刷网点出现扩大或丢失。
所以，防止柔性版网点印刷质量问题的出现，较好的解决方法，就是既要注意做好设备的保养，选择质量好、精度高的版材和高质量的油墨，又要注重把好操作技术关和印刷工艺技术关，当印刷机组有多余的情况下，印刷网线版和实地版并存的版面时，应考虑把网线版与实地版分开，分别单独进行印刷，这样既有利于印刷压力的准确控制，又有利于油墨的均匀涂布，提高柔印产品的印刷质量。
